第一，由于能够得到本部根据所制作的极其严密的特许“组件”而实行的指导和援助，会使加盟店增强对本部的依赖性，放松自我解决问题和改善经营的努力，减弱工作和劳动的积极性、主动性和创造性。
第二，由于采购商品与原材料、加工与销售方法、价格、店铺装饰、设备等的标准化以及运营的统一化，使加盟店自己开发出来的更好的方法等不能马上被采用。
第三，本部因考虑整体效果而制定和实行的措施，并不一定适合某些特定的加盟店的实际情况。
第四，在本部与加盟店有利害冲突的情况下，由于双方都是独立的事业者，本部会强调并维护自身利益。
第五，当某一加盟店失败、脱离连锁集团时，其他加盟店在形象和信用方面，会受到不良的连带影响。
第六，本部变更营业方针时，加盟店无权参与。
第七，对于合同内容，加盟店没有加入自己的要求和条件的余地。
第八，特许连锁是基于本部的商号、商标、技术诀窍来运营的，所以，当合同解除后，加盟店不能把过去的成果活用于自己的商誉。
第九，当本部脆弱化、大幅度改变销售政策时，加盟店即使没有责任，也不能够从本部充分地接受到指导与援助。
第十，当合同解除时，加盟店在加盟时所交纳的保证金，根据合同的规定有的不能得到返还。
