按现行增值税暂行条例规定，在连锁经营的方式下，总部对门店的商品配送，双方都存在计缴增值税的问题，有如下两种情况需要分别处理：
①由总部统一进货的商品，其进项税额可以记在总部的账上，无需随商品配送分摊给各门店。因为，由总部统一纳税可以简化许多税收计缴程序，降低纳税成本，因此，这里介绍销项税额在月末的结转方法。
A.计提时，门店编制会计分录(计提时总部无分录)如下：
借：主营业务收人
贷：应交税费——应交增值税(销项税额)
B.门店将销项税额上缴总部时：门店编制会计分录如下：
借：应交税费——
应交增值税(销项税额)
贷：总部往来(银行存款或内部银行存款)
总部编制会计分录如下：
借：门店往来(银行存款或内部银行存款)
贷：应交税费——应交增值税(销项税额)
倘若是门店自行采购的商品，其销项税额的会计处理方法同上。
对其进项税额的处理应于月末结转总部：
A.门店编制会计分录如下：
借：总部往来(银行存款或内部银行存款)
贷：应交税费——
应交增值税(进项税额)
B.总部编制会计分录如下：
借：应交税费——应交增值税(进项税额)
贷：门店往来(银行存款或内部银行存款)
